引言
仔猪腹泻易造成仔猪脱水死亡，严重危害养猪业的经济发展。目前有研究表明，具有猪白细胞抗原SLAⅡ类基因不同基因型的个体表现出对疾病抵抗能力的遗传差异^[1]，这种遗传差异是研究猪遗传育种和抗病性方面的基础。由于许多疾病往往受到多基因之间连锁遗传的影响。因此，本研究对烟台黑猪SLA-DQA和DRA基因编码区遗传多态性和单倍型进行了分析，旨在探究SLA-DQA和DRA基因的遗传变异及其基因型和单倍型对仔猪腹泻的影响。
材料与方法
试验对象为甘肃省红古区饲养场290头烟台黑猪，试验仔猪饲养管理和免疫水平相同，按腹泻评分0~3级标准记录仔猪腹泻情况。采用PCR-SSCP和克隆测序分析SLA-DQA和DRA外显子多态性，采用PHASE构建基因单倍型，采用SPSS软件统计基因型和单倍型与仔猪腹泻的相关性，利用ExPasy预测和分析蛋白质的理化性质。
结果与讨论
DQA基因exon 2（20 SNPs）、exon 3（9 SNPs）和exon 4（3 SNPs）分别检测到了4、6 和4种等位基因，5、8和7种基因型。DRA基因exon 1（2 SNPs）、exon 2（2 SNPs）、exon 4（7 SNPs）分别检测2、3和5种等位基因，3、4和8种基因型。统计分析显示，基因型极显著影响腹泻（P<0.01）。DQA exon 2基因型AB、AC 和AD，exon 3基因型BC 和DD和exon 4基因型BC，DRA exon 2基因型AC和exon 4基因型CC、DD 和AE为腹泻易感性基因型，DQA exon2基因型BB，exon3基因型AB，exon4基因型BB，DRA exon2基因型AA和exon4基因型BC为抗性基因型。DQA和DRA基因分别构建了20和14种主要单倍型(频率>2%)，单倍型极显著影响腹泻（P<0.01）。DQA基因Hap3，Hap18，Hap20和DRA基因Hap3，Hap11为腹泻易感性单倍型，DQA基因Hap4，Hap15和DRA基因Hap14则为抗性单倍型。