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DQA和DRA基因遗传多态和蛋白质特征对仔猪腹泻的遗传效应分析
相慧
北京博亚和讯农牧技术有限公司###
结果与讨论
DQA基因exon 2(20 SNPs)、exon 3(9 SNPs)和exon 4(3 SNPs)分别检测到了4、6 和4种等位基因,5、8和7种基因型。DRA基因exon 1(2 SNPs)、exon 2(2 SNPs)、exon 4(7 SNPs)分别检测2、3和5种等位基因,3、4和8种基因型。统计分析显示,基因型极显著影响腹泻(P<0.01)。DQA exon 2基因型AB、AC 和AD,exon 3基因型BC 和DD和exon 4基因型BC,DRA exon 2基因型AC和exon 4基因型CC、DD 和AE为腹泻易感性基因型,DQA exon2基因型BB,exon3基因型AB,exon4基因型BB,DRA exon2基因型AA和exon4基因型BC为抗性基因型。DQA和DRA基因分别构建了20和14种主要单倍型(频率>2%),单倍型极显著影响腹泻(P<0.01)。DQA基因Hap3,Hap18,Hap20和DRA基因Hap3,Hap11为腹泻易感性单倍型,DQA基因Hap4,Hap15和DRA基因Hap14则为抗性单倍型。研究还发现,易感性单倍型普遍具有DQA基因突变位点c.4096bpA>T,c.4110bpG>C,c.4619bpT>C[1]和DRA基因c.178A>G,c.4167A>G。DQA和DRA基因蛋白质在信号转导、受体、胁迫应答、免疫应答和生长因子的几率均较高。本研究表明SLA-DQA和DRA基因的单倍型间核苷酸的连锁遗传显著影响仔猪腹泻,为猪的抗病育种工作提供了重要信息,将在猪抗病机制和多基因遗传病研究发挥重要的作用。